Die Caritas-Schulen gGmbH werden satzungsgemäß von einem Beirat unterstützt, der die Geschäftsführung und den Gesellschafter in grundsätzlichen Fragen berät. Neben sogenannten geborenen Mitgliedern wie dem Schulreferenten der Diözese Würzburg sind vor allem Mitglieder aus den Bereichen Wissenschaft, Politik und Finanzen vertreten.
Der Gesellschafter wird vertreten durch den Vorsitzenden des Caritasverbandes für die Diözese Würzburg e.V., Domkapitular Monsignore Clemens Bieber und Frau Christina Birner.
Aktuelle wird die Caritas-Schulen gGmbH durch folgende Beiratsmitglieder unterstützt.
Hr. Sandro Kirchner, MdL (Vorsitzender)
Hr. Peter Ditze (Stellv. Vorsitzender)
Hr. Domkapitular Clemens Bieber
Fr. Kerstin Celina, MdL
Hr. Volkmar Halbleib, MdL
Hr. Steffen Vogel, MdL
Hr. Gustav Eirich
Hr. Jürgen Engel
Hr. Hartmut Lüft
Hr. Prof. Dr. Roland Stein
Fr. Christina Birner